RESUME DE THESE Domaine : Sciences de la Vie Spécialité :Biochimie et Génétique Moléculaire UFR : Biologie Appliquée et Valorisation des Ressources Naturelles Encadrant de thèse : Pr. Mohamed NHIRI Co-Encadrant de thèse : Pr. Franscisco Miguel CANOVAS RAMOS Responsable de l’UFR : Professeur Fouad SAYAH Titre de la thèse : Interaction carbone/azote chez le Sorgho (Sorghum sudangrass) dans le contexte du stress salin et azoté : Implication d’une Glutamine Synthétase racinaire dans la tolérance à l’ammonium. Prénom & Nom :Redouane ELOMARI Résumé :
Chez les végétaux les processus d’assimilation carboné et azoté sont intimement liés. L’étude
d’interaction entre ces deux voies métaboliques est très complexe. Si les relations entre ces deux
métabolismes sont bien établies, les cibles du métabolisme carboné sensibles à l’azote ne sont pas encore
identifiées. Une cartographie des enzymes essentiels du métabolisme carboné et azoté a été réalisée dans la
feuille, tissu et organe. La Fd-GOGAT et la GS2 s’accumulent dans la partie jeune du tissu foliaire, alors que
la PEPC et la Rubisco s’accumulent dans l’apex en corrélation avec la teneur en chlorophylle. Une nouvelle
forme d’AAT type procaryotique de 45 kDa a été mise en évidence pour la première fois dans les feuilles de
sorgho. Son expression est indépendante du cycle GS/GOGAT et s’accumule dans les racines en présence
des concentrations élevées du nitrate et d’ammonium, ce qui suggère son implication dans la régénération
des squelettes carbonés (ketoglutarate) à partir d’AOA pour l'assimilation primaire de l'ammonium. Le stress
salin induit une accumulation de proline, de sucres solubles et d’acides aminés dans les racines et les feuilles
de sorgho. Cette accumulation est concomitante à une stimulation du système antioxydant ainsi que
l’accumulation de la PEPC et GS. Les doses élevés d’azote en particulier l’ammonium, réduisent la
productivité végétale. Paradoxalement, le Sorghum sudangrass, montre une tolérance à des concentrations
excessives de cet ion qui peut aller jusqu’à 50 mM sans symptôme de toxicité. Cette tolérance est corrélée à
une accumulation racinaire en acides aminés conjointement avec celle de la PEPC et de la GS. Dans la
feuille, ces même variations sont associées à une augmentation de la teneur en chlorophylle et une biomasse
élevée. Les expériences de chromatographie échangeuse d’ions, d’électrophorèse 2D, d’immuoempreinte et
d’autre part, l’analyse d’expression génique nous ont permis de montrer que l’ammonium induit
spécifiquement l’accumulation d’une isoenzyme fonctionnelle GS1 de pI 5,04 et que cet isoforme est
principalement localisé dans la partie supérieure et latérale des racines du sorgho. Un autre isoforme
constitutif du même poids moléculaire avec un pI de 5,26 a été détecté dans la racine. L’analyse
bioinformatique des séquences de la GS de sorgho disponibles dans les bases de données et l’analyse de
l’expression de gènes montre que les deux isoformes de GS1 caractérisés dans ce travail peuvent être les
produits de l’expression de gènes SbGln1.2 et SbGln1.3 qui codent respectivement pour les polypeptides de
pI 5,26 et de pI 5,04. Les deux isoformes de GS1 exprimés dans les racines de sorgho ont relativement une
faible affinité pour l’ammonium, ce qui permet de maintenir une biosynthèse constante de la glutamine en
présence des concentrations élevées d’ammonium. Enfin, le stockage d’ammonium dans les racines et son
assimilation par les isoenzymes de faible affinité peut représenter un système efficace de détoxification de
l’ammonium. Ce mécanisme limite le transport de l’ammonium vers les feuilles et évite les conséquences de
ses effets toxiques, ce qui confère au sorgho une tolérance à des concentrations excessives d’ammonium.
Mots clés : Sorghum sudangrass, biomasse, carbone, ammonium, nitrate, NaCl, antioxydants, PEPC,
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